Сотрудники ЦКП «Филогеномика и транскриптомика» прошли обучение на базе «Синтол»

С 14 по 16 апреля начальник Центра коллективного пользования «Филогеномика и транскриптомика» ФИЦ ИнБЮМ, младший научный сотрудник лаборатории ландшафтной экологии и геоматики Дарья Игнатьева прошла расширенный обучающий курс от компании «Синтол» на тему: «Нанофор-05: оптимальное использование методики решения проблем». Трёхдневный интенсив был рассчитан на постоянных пользователей капиллярного секвенатора «Нанофор-05» и направлен на выявление и решение проблемных ситуаций, возникающих в ходе проведения молекулярно-генетического анализа - начиная с постановки ПЦР и реакции секвенирования до запуска прибора и обработки данных.

Во время обучения участники прослушали интерактивные лекции, провели практические занятия на станции автоматического выделения ДНК «Colibri», флуориметре «Qubix», генетическом анализаторе «Нанофор-05», а также поработали с новейшим программным обеспечением для обработки результатов GeneMarkerHID и Mutation Surveyor. Кроме того, они познакомились с новейшими отечественными разработками в области секвенирования по Сэнгеру, фрагментного анализа и NGS, изучили теоретические аспекты проведения микросателлитного анализа, поиска мутаций и пр. По завершению обучения всем 20 слушателям вручили сертификаты об успешном прохождении курса.   

«Больше всего мне понравилось, что занятия не сводились к простому прослушиванию и записи теории. Было много интерактива, практики, дискуссий, а также работы в группах над анализом проблемных данных. Особенно интересным оказался разбор на реальных кейсах основных проблем, с которыми сталкиваются пользователи, и их коллективное обсуждение с поиском решений», - отметила Дарья Игнатьева.

Накануне лаборант-исследователь ЦКП «Филогеномика и транскриптомика» Милена Бабич также приняла участие в школе «Введение в приложение НАНОФОР 05: генетика животных, растений и микроорганизмов», организованной компанией «Синтол». Для слушателей из разных городов России, занимающихся различными исследованиями в криминалистике, генетике, микробиологии и физиологии растений, провели лекции и мастер-классы, на которых демонстрировались особенности работы с приборами «Нанофор 05» и «Colibri».

 «Это была отличная стажировка, она дала возможность расширить свои навыки в работе с приборами, узнать их внутреннее устройство и принцип работы, особенности управления и обработки данных, что даст возможность решения перспективных генетических задач ФИЦ ИнБЮМ с помощью новейших методов секвенирования. Это был бесценный опыт, а полученные знания уже сейчас я смогу применять в рабочих задачах», - поделилась впечатлениями Милена Бабич.

Информация: 

- Научно-образовательный центр коллективного пользования «Филогеномика и транскриптомика», оснащённый современным оборудованием для широкого спектра генетических исследований, заработал на базе Института биологии южных морей в апреле 2023 года. В 2024 г. в ЦКП был запущен первый отечественный полногеномный секвенатор ДНК «Нанофор СПС», который совместно разработали специалисты Института аналитического приборостроения РАН и компании «Синтол». До этого такие установки выпускались исключительно в США и Китае.

- С помощью прибора учёные выполняют автоматизированное определение последовательности нуклеотидов в цепи ДНК, то есть секвенирование путём синтеза на отечественной реагентике. Технология полногеномного секвенирования ДНК на сегодняшний день является наиболее современным подходом для изучения генома биологических объектов, что открывает большие перспективы для понимания процессов, лежащих в основе функционирования и эволюции живых систем.